多组学数据分析服务，Broaden your research！
        
      结合两种或两种以上组学研究方法，如基因组、转录组、蛋白组或代谢组，对生物样本进行系统研究，同时将各组学的数据加以整合分析并深入挖掘生物学数据的分析方法，可以更系统的解析生物体的内在机制。
 

       蛋白质组是一种基因组所表达的全套蛋白质，即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。蛋白质是生物体直接的功能执行者，蛋白质的表达水平改变，翻译后修饰、蛋白间相互作用，蛋白构象改变对生理病理过程有及其重要影响。

       转录组广义上指某一生理条件下，细胞内所有转录产物的集合，包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA；狭义上指所有mRNA的集合。转录组是连接基因组遗传信息与生物功能的蛋白质组的必然纽带。转录组研究能够从整体水平研究基因功能及基因结构，揭示特定的生物学过程，应用于生物体候选基因发掘、功能鉴定、临床诊断、药物研发等领域。

       代谢组作为后基因时代系统生物学驱动的新生代组，其核心是通过定性描述和定量表征不同生物基质中小分子代谢物的变化，来探索生物体与细胞代谢相关的关键科学问题。代谢组学代表了表型状态及调控功能活性，能调节蛋白质-蛋白质相互作用，改变酶活性，反馈调控机体代谢状态。

多组学联合分析已经被运用于生物领域的各个方面！

多组学模型构建在临床研究中的应用

一、中医学领域——不同体质人群中的蛋白水平及相关性研究

       在中医学中，为了更客观的探索中医学的体质表达，研究人员Fei Tan，使用RayBio抗体芯片（GSH-CAA-X00）分析了两种不同体质（健康体质(BC)和湿体质(DC)，包括痰湿体质和湿热体质）的血清学蛋白谱，和随时间变化的体质概况，利用找到的差异蛋白进行模型构建，共表达网络分析，将患者性状及分子水平联系起来。

 

       芯片结果经过分析找到了18个有差异表达的蛋白，其中有11个上调，7个下调。

 

       通过进一步降维，将差异蛋白缩小到了7个，再将7个差异蛋白利用SVM模型及ROC观察表达情况。

 

       再将这些差异蛋白与临床性状进行相关性分析，可以看到这些体质与日常生活中的作息、饮食等具有相关性。

二、标志物筛选——机器学习筛选确定肝癌检测最佳标志物组合

       目前临床上多用AFP（甲胎蛋白）作为肝癌患者的检测标志物，但有30%~40%的患者不表达AFP，为了寻找肝细胞癌(HCC)新的标志物替换肝癌的AFP或者辅助APF检测。

       RayBio科学家利用AAH-CYT-G4000芯片对患者肝癌和癌旁组织进行初步筛选，通过多组学数据处理初步筛选出了33个差异蛋白，在通过火山图将差异蛋白范围缩小。

 

       将筛选出的蛋白经过GO和KEGG进行相关性分析，观察这些蛋白与哪些信号通路或者功能上具有联系。

 

       再联合文献中的差异蛋白定制了一款检测18个差异蛋白的芯片，在其中进一步精确寻找可靠标志物。

 

       将获得的数据通过共线性去除、及利用LR、LDA、RF、SVM模型评估，对比其训练集及测试集的表现情况，及进一步降维，最后确定了4种蛋白（AFP、GDF-15、CEACAM-1和MMP-9）表达模型，可作为肝癌患者确诊的检测标志物最佳组合。

 

      RayBio蛋白质芯片作为蛋白质组学研究的一种重要手段，已与其他多组学联合分析，通过将基因、调控因子、蛋白、代谢物等不同层面之间信息进行整合，构建基因调控网络，深层次理解各个分子之间的调控及因果关系，从而更深入认识生物进程和疾病过程中复杂性的分子机理和遗传基础。

 

 

RayBiotech可为您提供多组学数据联合分析服务，让您的研究更加全面！

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数据分析内容

       转录组和蛋白质组联合分析mRNA-蛋白质关联性，对生物样本进行系统研究可以全面探究生物体疾病机理、胁迫机制，精确研究重要基因的表达模式和调控机理。
 

 

       蛋白组与代谢组联合分析，通过寻找某一重要代谢通路中差异表达蛋白以及发生改变的代谢物，探讨两者的关系，锁定同一生物进程的相互关联的关键蛋白和代谢物，挖掘相关靶标分子。

       转录组与代谢组联合分析，通过KEGG代谢通路将代谢组和转录组联合起来，找到参与同一生物进程中发生显著性变化的基因和代谢物，快速锁定关键靶标。
 

       从16S、代谢层面分别筛选组间差异的菌株和代谢物，然后基于两者表达量的相关性进行联合分析，多角度揭示特定菌群与特定代谢物（群）之间的关联性，筛选引起菌群代谢状态或 功能性代谢小分子变化的关键菌株。
 

分析结果图

蛋白质组与转录组联合分析

 

蛋白质组与代谢组联合分析
 

16s与代谢组学联合分析

 

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About RayBiotech

       在科研领域，RayBio累计支持客户发表影响因子3分以上的SCI文章超过10000余篇，影响因子超过47001分，影响因子>5的文章超过4167篇，影响因子>10的文章超过395篇，影响因子>20的文章超过58篇。RayBio作为国际领先的蛋白芯片和免疫产品专业供应商，拥有世界上种类最多的抗体芯片及ELISA及产品，其产品检测灵敏度高，种属多样，包括涵盖人、小鼠、大鼠、猪、马、牛、猴、犬、猫、兔等多个种属。

 

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